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Breeder’s Blog

  • “When Genes Interact: Epistatic Models and Modified Ratios in Two-Gene Inheritance”

    “When Genes Interact: Epistatic Models and Modified Ratios in Two-Gene Inheritance”

    In this article, we explore the main types of two-gene epistasis and how they modify the classical 9:3:3:1 Mendelian ratio observed under independent assortment, leading to characteristic F₂ segregation patterns.

    Leer más: “When Genes Interact: Epistatic Models and Modified Ratios in Two-Gene Inheritance”
  • “Genotyping for All: How Small Breeding Programs Can Afford Modern Molecular Tools”

    “Genotyping for All: How Small Breeding Programs Can Afford Modern Molecular Tools”

    Many small and medium-sized breeding programs hesitate to adopt molecular tools due to perceived high costs. The good news? Affordable genotyping strategies exist, allowing breeders to harness molecular breeding without breaking the bank.

    Leer más: “Genotyping for All: How Small Breeding Programs Can Afford Modern Molecular Tools”
  • “Heritability Scores in Breeding: Practical Benefits, Realities and Misconceptions “

    “Heritability Scores in Breeding: Practical Benefits, Realities and Misconceptions “

    Heritability scores offer significant benefits , helping breeders make informed decisions, yet breeding misconceptions often lead to missed opportunities and errors. This post explores the true value of heritability and clears up common misunderstandings

    Leer más: “Heritability Scores in Breeding: Practical Benefits, Realities and Misconceptions “
  • Accelerating Breeding with Molecular Markers: A Step-by-Step Guide and Case Study

    Accelerating Breeding with Molecular Markers: A Step-by-Step Guide and Case Study

    If you’re new to molecular markers, this guide will walk you through the process step by step, providing practical tips and a case study.

    Leer más: Accelerating Breeding with Molecular Markers: A Step-by-Step Guide and Case Study

Email: info@agrosynapsis.com

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GenoMetrics-DELIVERABLES

Heredabilidad de traits

Calculamos la heredabilidad de los traits usando los datos fenotípicos disponibles; luego, le asesoramos sobre cómo diseñar su estrategia de mejoramiento y le damos consejos sobre cómo mejorar la heredabilidad y aumentar la eficiencia de la selección.

Diseño experimental

Creamos un diseño experimental que minimiza el efecto de la condiciones del entorno. Esto se logra incorporando el número adecuado de réplicas y bloques.

La formula de mejorador (o Breeder's Equation)

Proporcionamos predicciones de ganancia genética, estrategias de selección optimizadas e informes personalizados para ayudar a los mejoradores a tomar decisiones acertadas.

Traits Mendelianos y Cuantitativos

Estudiamos y reportamos el control genético de cualquier trait, desde traits mendelianos simples hasta más complejos. Identificamos los ratios de segregación mendeliana y generamos distribuciones continuas para los traits más complejos.

Correlaciones de Traits

Proporcionamos informes personalizados sobre relaciones de traits, oportunidades de selección indirecta y estrategias de selección de múltiples traits.

GenoMetrics-Benefits

Estimación de la Heredabilidad - Mide con precisión qué proporción de la variación de un trait es genética, lo que guía a los mejoradores a centrarse en traits con mayor potencial de ganancia genética.

Diseño Experimental Optimizado - Garantiza que los experimentos sean estadísticamente sólidos, reduciendo errores y mejorando la confiabilidad de los resultados en todos los ensayos y entornos.

Validación de Modelos Genéticos - Confirma si los patrones de transmisión genética observados siguen modelos esperados (por ejemplo, la genética mendeliana), lo que garantiza la validez de las estrategias de mejora.

La formula de mejorador (o Breeder's Equation) - calcula la ganancia genética esperada en las próximas generaciones, optimiza la intensidad de la selección y mejora la eficiencia de la mejora a largo plazo.

Correlación entre traits - ayuda los mejoradores a seleccionar un trait para mejorar otro mientras intentan equilibrar los cambios opuestos, ya que mejorar un trait podría causar que otro disminuya.

 

GenoDiverse-Benefits

Maximizar la variación genética dentro de las especies vegetales, una condición necesaria para introducir nuevos caracteres

Reducir el riesgo de perder variantes genéticas raras pero valiosas.

Identificación de material pre-breeding en poblaciones silvestres o autóctonas.

Acelerar el progreso del breeding facilitando la selección de líneas parentales complementarias.

Proporcionar marcadores polimórficos listos para usar en programas de selección asistida por marcadores.

GenoSelection-Beneficios

Aumentar la precisión en la selección dirigiéndose a genes o regiones genómicas asociadas con esos traits

Permitir la detección temprana de traits en la etapa de semilla o plántula, ahorrando tiempo y recursos,

Proporcionar una mayor precisión de selección, especialmente para los traits cuya expresión está influenciada por factores ambientales o se fenotipan mediante protocolos complejos.

Acelerar el progreso de la mejora aumentando precisión y la eficiencia de la selección

GenoSelection-ENTREGABLES

Informe Bibliográfico Completo

Revisamos en profundidad la información pública sobre el control genético de los traits de interés. A través de este informe, podrá comprender los mecanismos genéticos subyacentes y adaptar las estrategias adecuadas de marcadores asociados. .

Estrategia de desarrollo de marcadores

Desarrollamos ensayos para marcadores moleculares publicados o realizamos descubrimientos de novo de asociaciones de marcadores con traits de interés. Esta estrategia puede implicar análisis QTL, GWAS u otras técnicas genómicas avanzadas para identificar marcadores vinculados tanto a traits mendelianos simples como a traits poligénicos complejos.

Mapas Genéticos

Generamos mapas genéticos que ilustran las ubicaciones físicas de los marcadores moleculares en todo el genoma de la planta.

 Informe de del Análisis de asociación Marcador-Trait

Reportamos los marcadores identificados, sus localizaciones genómicas y sus asociaciones con el trait de interés. Se pueden incluir medios visuales como gráficos y tablas para facilitar la interpretación

Paneles de marcadores personalizados

 Diseñamos paneles de marcadores informativos asociados a un trait específico y validados en diferentes poblaciones reproductoras, asegurando los marcadores polimórficos disponibles para cualquier cruzamiento de líneas parentales.

Recomendaciones de selección asistida por marcadores (MAS)

Recomendamos estrategias para programas de selección asistida por marcadores (MAS, por sus siglas en inglés) basadas en las asociaciones marcador-trait identificadas

GenoPrecision-Beneficios 

Modificación precisa de los genes de interés. 

Versatilidad por la aplicación a una amplia gama de especies y traits vegetales.

 Soluciones sostenibles a los desafíos de la agricultura, como la resistencia a las enfermedades, la resiliencia climática y la calidad nutricional.

GenoPrecision-Entregables

Identificación de genes candidatos

Identificamos genes candidatos mediante el uso de herramientas computacionales avanzadas y bases de datos. Basamos su selección en sus funciones conocidas, patrones de expresión y asociaciones genéticas con los traits de interés

Análisis de alelos causales

Determinamos los alelos causales dentro de los genes candidatos identificados responsables de la expresión de los traits de interés. Para ello, investigamos las variaciones alélicas, los polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs), las inserciones, las deleciones y otras variaciones genéticas que influyen directamente en la expresión de los traits.

Propuesta de estrategia de edición genética

A partir de los genes candidatos identificados y los alelos causales, proponemos estrategias de edición génica a medida para el cliente. Esto puede incluir recomendaciones para la edición CRISPR-Cas9, la mutagénesis EMS o otras técnicas de edición genética.

Diseño de la secuencia candidata

Proporcionamos orientación sobre el diseño de secuencias candidatas para la edición CRISPR-Cas9 o la mutagénesis EMS.

Informe Final y Recomendaciones

El servicio concluye con la entrega de un informe final completo que resume la identificación del gen candidato, el análisis de alelos causales, la propuesta de estrategia de edición de genes y las recomendaciones de diseño de secuencias.

GenoDiverse-Deliverables

Estrategia de la plataforma de genotipado

Recomendamos estrategias de plataforma de genotipado en función de su presupuesto y necesidades específicas. Le guiamos en la selección de la tecnología de genotipado más adecuada, como paneles de SNP, análisis SSR o secuenciación dirigida, teniendo en cuenta factores como la rentabilidad, el rendimiento y la resolución.

Informe de Diversidad Genética

Entregamos un informe completo que describe la diversidad genética dentro de su población . Mediante el uso de herramientas visuales como dendrogramas, Heat maps, gráficos de agrupamiento y valores de diversidad, el informe proporcionará un análisis detallado de las relaciones genéticas, la estructura de la población y los índices de diversidad. Estas herramientas ofrecen información clara sobre la distribución de la variación genética en su grupo genético y ayudan a tomar decisiones informadas sobre sus estrategias de mejoramiento.

Identificación de marcadores polimórficos o haplotipos

Entregamos una lista seleccionada de marcadores polimórficos o haplotipos en torno a los genes de interés para su programa de mejoramiento. Estos marcadores o haplotipos se asocian con variantes genéticas favorables, lo que permite una selección eficiente asistida por marcadores.

Estrategia de Utilización de la Variación Genética

Recomendamos estrategias para optimizar la utilización de la variación genética en su programa de mejoramiento. Puede incluir recomendaciones para la selección parental, los diseños de apareamiento y la introgresión alélica. De esta manera, esperamos ayudarlo a mejorar la expresión de traits y acelerar el progreso del breeding.

Aumentar la precisión en la selección dirigiéndose a genes o regiones genómicas asociadas con esos traits

Permitir la detección temprana de traits en la etapa de semilla o plántula, ahorrando tiempo y recursos,

Proporcionar una mayor precisión de selección, especialmente para los traits cuya expresión está influenciada por factores ambientales o se fenotipan mediante protocolos complejos.

Acelerar el progreso de la mejora aumentando precisión y la eficiencia de la selección